Deux méthodes pour l’estimation de la diversité chez les communautés d’oiseaux à l’aide de données issues des sciences participatives - Université Claude Bernard Lyon 1 Accéder directement au contenu
Thèse Année : 2019

Two Methods for Estimating Diversity in Bird Communities Using Data from Citizen Science

Deux méthodes pour l’estimation de la diversité chez les communautés d’oiseaux à l’aide de données issues des sciences participatives

Résumé

The aim of this Master thesis was to integrate data from participatory science for the estimation of the distribution of bird communities. We then present the citizen science and the data derived from it, as well as the growing interest of volunteers in these programs. We focus on the data from the French Breeding Bird Survey (Suivi Temporel des Oiseaux Commun, STOC), which involves a survey of common birds from a standardised monitoring scheme. Numerous models exist for estimating the joint distribution of species and we have decided to focus on two of these models: the model from Ovaskainen et al. (2017; Hierarchical Modelling of Species Communities) and the model from Clark et al. (2014; Generalized Joint Attribute Modelling). We explain the mechanisms underlying of these models by comparing them in a theoretical framework, and also by applying them to the STOC data. Finally, this study lead us to conclude which model is the most efficient based on functionality, statistical construction, and whether the model is well adapted to the types of data it faces. We end up presenting existing leads and models integrating so-called 'opportunistic' data. Since opportunistic data are collected by non-professional volunteers, they add important biases that need to be addressed.
Ce stage de Master 2 avait pour but d’intégrer des données issues des sciences participatives pour l’estimation de la distribution de communautés d’oiseaux. Nous présentons alors les sciences participatives et les données qui en découlent ainsi que l’intérêt croissant de volontaires envers ces programmes. Nous nous arrêtons sur les données issus du Suivi Temporel des Oiseaux Communs ou STOC qui repose sur des observations d’oiseaux communs issues d’un suivi protocolé. De nombreux modèles existent pour l’estimation de la distribution jointe d’espèces et nous avons décidé de nous focaliser sur deux de ces modèles: le modèle HSMC de Ovaskainen et al. (2017; Hierarchical Modelling of Species Communities) et le modèle GJAM de Clark et al. (2014; Generalized Joint Attribute Modelling). Nous expliquons les mécanismes de ces modèles en les comparant d’une manière théorique, mais aussi en les appliquant avec les données du STOC. Cette étude nous amène à conclure quel modèle est le plus efficace en s’appuyant sur les fonctionnalités, la construction statistique et déterminer si le modèle est bien adapté aux types de données auxquelles il est confronté. Enfin, nous présentons des pistes et des modèles existants intégrant des données dites ’opportunistes’. Les données opportunistes étant recueillies par des volontaires non-professionnels, elles ajoutent des biais importants qu’il est nécessaire de résoudre.
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Dates et versions

Identifiants

  • HAL Id : tel-03127871 , version 1

Citer

Florian Grill. Deux méthodes pour l’estimation de la diversité chez les communautés d’oiseaux à l’aide de données issues des sciences participatives. Biodiversité et Ecologie. Ecole Polytechnique Paris, 2019. Français. ⟨NNT : ⟩. ⟨tel-03127871⟩
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