Genetic overlap between autoimmune diseases and non‐Hodgkin lymphoma subtypes - Université Claude Bernard Lyon 1 Accéder directement au contenu
Article Dans Une Revue Genetic Epidemiology Année : 2019

Genetic overlap between autoimmune diseases and non‐Hodgkin lymphoma subtypes

Lennox Din , Mohammad Sheikh , Nikitha Kosaraju , Karin Ekström Smedby (1) , Sasha Bernatsky (2) , Sonja I Berndt (3) , Christine Skibola (4) , Alexandra Nieters (5) , Sophia Wang , James Mckay (6) , Pierluigi Cocco (7) , Marc Maynadié (8) , Lenka Foretova (9) , Anthony Staines (10) , Thomas Mack , Silvia Sanjosé , Timothy Vyse (11) , Leonid Padyukov (12) , Alain A. Monnereau (13, 14) , Alan Arslan , Amy Moore (15) , Angela Brooks‐wilson , Anne Novak , Bengt Glimelius (16) , Brenda Birmann , Brian Link (17) , Carolyn Stewart , Claire Vajdic , Corinne Haioun (18) , Corrado Magnani , David Conti , David G Cox (19) , Delphine Casabonne , Demetrius Albanes (20) , Eleanor Kane , Eve Roman (21) , Giacomo Muzi , Gilles Salles (22) , Graham G Giles (23) , Hans‐olov Adami , Hervé Ghesquieres (24) , Immaculata Vivo , Jacqueline Clavel (13) , James Cerhan (25) , John Spinelli , Jonathan N Hofmann (26) , Joseph Vijai (27) , Karen Curtin (28) , Karen Costenbader , Kenan Onel , Kenneth Offit (29) , Lauren Teras , Lindsay M. Morton (3) , Lucia Conde , Lucia Miligi (30) , Mads Melbye (31) , Maria Grazia Ennas (32) , Mark Liebow , Mark P. Purdue (3) , Martha Glenn (28) , Melissa Southey (33) , Morris Din , Nathaniel Rothman (3) , Nicola Camp , Nicole Wong Doo , Nikolaus Becker (34) , Nisha Pradhan , Paige Bracci , Paolo Boffetta (35) , Paolo Vineis (36) , Paul Brennan (6) , Peter Kraft (37) , Qing Lan , Richard K. Severson (38) , Roel Vermeulen (39) , Roger L Milne (40) , Rudolph Kaaks , Ruth Travis (41) , Stephanie Weinstein , Stephen Chanock (42) , Stephen Ansell (25) , Susan Slager (25) , Tongzhang Zheng , Yawei Zhang (43) , Yolanda Benavente (44) , Zachary Taub , Lohith Madireddy , Pierre‐antoine Gourraud , Jorge R Oksenberg (45) , Wendy Cozen (46) , Henrik Hjalgrim , Pouya Khankhanian (45)
1 Department of Medicine
2 MUHC - McGill University Health Center [Montreal]
3 NCI-NIH - National Cancer Institute [Bethesda]
4 Emory University [Atlanta, GA]
5 Center for Chronic Immunodeficiency (CCI), University Medical Center Freiburg, Freiburg, Germany
6 IACR - International Agency for Cancer Research
7 Department of Public Health
8 Registre des hémopathies malignes de Côte d'Or
9 MUNI - Masaryk University [Brno]
10 GRAPHOS - IFROSS Recherche
11 Faculty of Medicine
12 Karolinska Institutet [Stockholm]
13 Epidémiologie environnementale des cancers
14 CRESS (U1153 / UMR_A_1125 / UMR_S_1153) - Centre de Recherche Épidémiologie et Statistique Sorbonne Paris Cité
15 Department of Chemistry and Biochemistry [Boulder]
16 Uppsala Universitet [Uppsala]
17 Carver College of Medicine, University of Iowa
18 Service d'hématologie clinique
19 UNICANCER/CRCL - Centre de Recherche en Cancérologie de Lyon
20 Division of Cancer Epidemiology and Genetics
21 Health Sciences
22 Service de Radio-Oncologie [Lyon]
23 University of Melbourne
24 Centre Léon Bérard [Lyon]
25 Mayo Clinic [Rochester]
26 Occupational and Environmental Epidemiology Branch [Bethesda, Maryland]
27 Memorial Sloane Kettering Cancer Center [New York]
28 Huntsman Cancer Institute
29 Clinical Genetics Service
30 ISPO - Cancer Prevention and Research Institute
31 Dept. of Epidemiology Research
32 B.B. Brodie Department of Neuroscience
33 Department of Pathology
34 Division of Cancer Epidemiology
35 Unit of Environment Cancer Epidemiology
36 CPO Piemonte - Centro di Riferimento per l'Epidemiologia e la Prevenzione Oncologica in Piemonte = Center for Cancer Prevention-Piemonte
37 Department of Epidemiology
38 Wayne State University [Detroit]
39 Division of Environmental Epidemiology
40 Cancer Epidemiology Centre
41 Cancer Epidemiology Unit
42 Division of Cancer Epidemiology and Genetics
43 MONARIS - De la Molécule aux Nanos-objets : Réactivité, Interactions et Spectroscopies
44 Department of Epidemiology
45 Department of Neurology [San Francisco, CA, USA]
46 Norris Comprehensive Cancer Center
Lennox Din
  • Fonction : Auteur
Mohammad Sheikh
  • Fonction : Auteur
Nikitha Kosaraju
  • Fonction : Auteur
Karin Ekström Smedby
  • Fonction : Auteur
  • PersonId : 887297
Sophia Wang
  • Fonction : Auteur
Anthony Staines
  • Fonction : Auteur
  • PersonId : 1042813
Thomas Mack
  • Fonction : Auteur
Silvia Sanjosé
  • Fonction : Auteur
Timothy Vyse
  • Fonction : Auteur
  • PersonId : 881649
Alan Arslan
  • Fonction : Auteur
Angela Brooks‐wilson
  • Fonction : Auteur
Anne Novak
  • Fonction : Auteur
Brenda Birmann
  • Fonction : Auteur
Carolyn Stewart
  • Fonction : Auteur
Claire Vajdic
  • Fonction : Auteur
Corrado Magnani
  • Fonction : Auteur
David Conti
  • Fonction : Auteur
Delphine Casabonne
Eleanor Kane
  • Fonction : Auteur
Eve Roman
  • Fonction : Auteur
  • PersonId : 906239
Giacomo Muzi
  • Fonction : Auteur
Gilles Salles
  • Fonction : Auteur
  • PersonId : 997016
Hans‐olov Adami
  • Fonction : Auteur
Immaculata Vivo
  • Fonction : Auteur
John Spinelli
  • Fonction : Auteur
Karen Costenbader
  • Fonction : Auteur
Kenan Onel
  • Fonction : Auteur
Lauren Teras
  • Fonction : Auteur
Lucia Conde
  • Fonction : Auteur
Mark Liebow
  • Fonction : Auteur
Melissa Southey
  • Fonction : Auteur
  • PersonId : 918639
Morris Din
  • Fonction : Auteur
Nathaniel Rothman
  • Fonction : Auteur
  • PersonId : 906255
Nicola Camp
  • Fonction : Auteur
Nicole Wong Doo
  • Fonction : Auteur
Nikolaus Becker
  • Fonction : Auteur
  • PersonId : 910633
Nisha Pradhan
  • Fonction : Auteur
Paige Bracci
  • Fonction : Auteur
Peter Kraft
Qing Lan
  • Fonction : Auteur
Rudolph Kaaks
  • Fonction : Auteur
Ruth Travis
  • Fonction : Auteur
  • PersonId : 950018
Stephanie Weinstein
  • Fonction : Auteur
Stephen Ansell
Susan Slager
  • Fonction : Auteur
  • PersonId : 1010875
Tongzhang Zheng
  • Fonction : Auteur
Yolanda Benavente
  • Fonction : Auteur
  • PersonId : 904182
Zachary Taub
  • Fonction : Auteur
Lohith Madireddy
  • Fonction : Auteur
Pierre‐antoine Gourraud
  • Fonction : Auteur
Henrik Hjalgrim
  • Fonction : Auteur

Résumé

Epidemiologic studies show an increased risk of non-Hodgkin lymphoma (NHL) in patients with autoimmune disease (AD), due to a combination of shared environmental factors and/or genetic factors, or a causative cascade: chronic inflammation/antigen-stimulation in one disease leads to another. Here we assess shared genetic risk in genome-wide-association-studies (GWAS). Secondary analysis of GWAS of NHL subtypes (chronic lymphocytic leukemia, diffuse large B-cell lymphoma, follicular lymphoma, and marginal zone lymphoma) and ADs (rheumatoid arthritis, systemic lupus erythematosus, and multiple sclerosis). Shared genetic risk was assessed by (a) description of regional genetic of overlap, (b) polygenic risk score (PRS), (c)"diseasome", (d)meta-analysis. Descriptive analysis revealed few shared genetic factors between each AD and each NHL subtype. The PRS of ADs were not increased in NHL patients (nor vice versa). In the diseasome, NHLs shared more genetic etiology with ADs than solid cancers (p = .0041). A meta-analysis (combing AD with NHL) implicated genes of apoptosis and telomere length. This GWAS-based analysis four NHL subtypes and three ADs revealed few weakly-associated shared loci, explaining little total risk. This suggests common genetic variation, as assessed by GWAS in these sample sizes, may not be the primary explanation for the link between these ADs and NHLs.

Dates et versions

inserm-02286174 , version 1 (13-09-2019)

Identifiants

Citer

Lennox Din, Mohammad Sheikh, Nikitha Kosaraju, Karin Ekström Smedby, Sasha Bernatsky, et al.. Genetic overlap between autoimmune diseases and non‐Hodgkin lymphoma subtypes. Genetic Epidemiology, 2019, ⟨10.1002/gepi.22242⟩. ⟨inserm-02286174⟩
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