Mutation allele burden remains unchanged in chronic myelomonocytic leukaemia responding to hypomethylating agents
Jane Merlevede
(1, 2)
,
Nathalie Droin
(1, 2, 3)
,
Tingting Qin
(4)
,
Kristen Meldi
(5)
,
Kenichi Yoshida
(6, 7)
,
Margot Morabito
(2, 1)
,
Emilie Chautard
(8)
,
Didier Auboeuf
(9)
,
Pierre Fenaux
(10)
,
Thorsten Braun
(11)
,
Raphaël Itzykson
(1, 10)
,
Stéphane de Botton
(12)
,
Bruno Quesnel
(13)
,
T. Commes
(14)
,
Eric Jourdan
(15)
,
William Vainchenker
(2)
,
Olivier Bernard
(16)
,
Noémie Pata-Merci
(3)
,
Stéphanie Solier
(17, 16)
,
Velimir Gayevskiy
(18)
,
Marcel E Dinger
(18)
,
Mark J. Cowley
(18)
,
Dorothée Selimoglu-Buet
(16)
,
Vincent Meyer
(19)
,
François Artiguenave
(19)
,
Jean-François Deleuze
(19)
,
Claude Preudhomme
(20)
,
Michael Stratton
(21)
,
Ludmil B. Alexandrov
(21, 22)
,
Eric Padron
(23)
,
Seishi Ogawa
(7)
,
Serge Koscielny
(24)
,
Maria Figueroa
(4)
,
Eric Solary
(2)
1
Hématopoïèse normale et pathologique
2 Dynamo - Dynamique moléculaire de la transformation hématopoïétique
3 AMMICa - Analyse moléculaire, modélisation et imagerie de la maladie cancéreuse
4 University of Michigan Medical School [Ann Arbor]
5 School of Information, University of Michigan
6 Department of Molecular Diagnosis
7 Kyoto University
8 LBBE - Laboratoire de Biométrie et Biologie Evolutive - UMR 5558
9 UNICANCER/CRCL - Centre de Recherche en Cancérologie de Lyon
10 AP-HP - Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP)
11 Hôpital Avicenne [AP-HP]
12 Département d'hématologie [Gustave Roussy]
13 CHRU Lille - Centre Hospitalier Régional Universitaire [CHU Lille]
14 Cellules souches normales et cancéreuses
15 CHU Nîmes - Centre Hospitalier Universitaire de Nîmes
16 U1170 Inserm - Hématopoïèse normale et pathologique
17 IGR - Institut Gustave Roussy
18 Garvan Institute of medical research
19 CNG - Centre National de Génotypage
20 Service d'Hématologie Cellulaire [Lille]
21 The Wellcome Trust Sanger Institute [Cambridge]
22 LANL - Los Alamos National Laboratory
23 H. Lee Moffitt Cancer Center and Research Institute
24 SBE - Service de biostatistique et d'épidémiologie
2 Dynamo - Dynamique moléculaire de la transformation hématopoïétique
3 AMMICa - Analyse moléculaire, modélisation et imagerie de la maladie cancéreuse
4 University of Michigan Medical School [Ann Arbor]
5 School of Information, University of Michigan
6 Department of Molecular Diagnosis
7 Kyoto University
8 LBBE - Laboratoire de Biométrie et Biologie Evolutive - UMR 5558
9 UNICANCER/CRCL - Centre de Recherche en Cancérologie de Lyon
10 AP-HP - Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP)
11 Hôpital Avicenne [AP-HP]
12 Département d'hématologie [Gustave Roussy]
13 CHRU Lille - Centre Hospitalier Régional Universitaire [CHU Lille]
14 Cellules souches normales et cancéreuses
15 CHU Nîmes - Centre Hospitalier Universitaire de Nîmes
16 U1170 Inserm - Hématopoïèse normale et pathologique
17 IGR - Institut Gustave Roussy
18 Garvan Institute of medical research
19 CNG - Centre National de Génotypage
20 Service d'Hématologie Cellulaire [Lille]
21 The Wellcome Trust Sanger Institute [Cambridge]
22 LANL - Los Alamos National Laboratory
23 H. Lee Moffitt Cancer Center and Research Institute
24 SBE - Service de biostatistique et d'épidémiologie
Nathalie Droin
- Fonction : Auteur
- PersonId : 770388
- IdHAL : nathalie-droin-44106
- ORCID : 0000-0002-6099-5324
- IdRef : 176330593
Emilie Chautard
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1528
- IdHAL : emilie-chautard
- ORCID : 0000-0003-1456-5347
- IdRef : 174803486
Bruno Quesnel
- Fonction : Auteur
- PersonId : 767595
- ORCID : 0000-0002-6563-2709
- IdRef : 059849010
T. Commes
- Fonction : Auteur
- PersonId : 743232
- IdHAL : therese-commes
- ORCID : 0000-0002-7918-0176
- IdRef : 112246419
William Vainchenker
- Fonction : Auteur
- PersonId : 757193
- ORCID : 0000-0003-4705-202X
- IdRef : 084304685
Stéphanie Solier
- Fonction : Auteur
- PersonId : 800735
- ORCID : 0000-0003-3867-4644
Dorothée Selimoglu-Buet
- Fonction : Auteur
- PersonId : 791830
- ORCID : 0000-0002-3565-2709
Michael Stratton
- Fonction : Auteur
- PersonId : 904434
Eric Padron
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1090159
Eric Solary
- Fonction : Auteur
- PersonId : 757151
- IdHAL : eric-solary
- ORCID : 0000-0002-8629-1341
- IdRef : 050500031
Résumé
The cytidine analogues azacytidine and 5-aza-2'-deoxycytidine (decitabine) are commonly used to treat myelodysplastic syndromes, with or without a myeloproliferative component. It remains unclear whether the response to these hypomethylating agents results from a cytotoxic or an epigenetic effect. In this study, we address this question in chronic myelomonocytic leukaemia. We describe a comprehensive analysis of the mutational landscape of these tumours, combining whole-exome and whole-genome sequencing. We identify an average of 14±5 somatic mutations in coding sequences of sorted monocyte DNA and the signatures of three mutational processes. Serial sequencing demonstrates that the response to hypomethylating agents is associated with changes in DNA methylation and gene expression, without any decrease in the mutation allele burden, nor prevention of new genetic alteration occurence. Our findings indicate that cytosine analogues restore a balanced haematopoiesis without decreasing the size of the mutated clone, arguing for a predominantly epigenetic effect.
Domaines
Sciences du Vivant [q-bio]
Fichier principal
IRMB 13_P39_ Mutation allele burden remains unchanged in chronic myelomonocytic leukaemia responding to hypomethylating agents_ncomms10767.pdf (2.35 Mo)
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