Segmentation des muscles individuels en IRM basée sur des approches de recalage non-linéaire - Université Claude Bernard Lyon 1 Accéder directement au contenu
Poster De Conférence Année : 2017

Segmentation des muscles individuels en IRM basée sur des approches de recalage non-linéaire

Résumé

Objectif : Cette étude propose un algorithme de segmentation permettant une propagation transversale entre deux coupes axiales situées aux extrémités du volume d’intérêt et sur lesquelles les masques des muscles individuels ont été dessinés manuellement. Cette méthode consiste à fusionner plusieurs champs de déformations 2D résultants de différentes approches de recalages non-linéaires estimés entre les deux coupes extrêmes. Le résultat de cette fusion est un champ de déformation décrivant une trajectoire dite «Lagrangienne » permettant de suivre de façon optimale les variations anatomiques des muscles.Matériels et méthodes : La méthode proposée dans cette étude est une méthode semiautomatique permettant, à partir de la segmentation manuelle des deux coupes 2D (M0 et Mn) situées aux limites inférieures et supérieures d’un volume d'intérêt, d’obtenir la segmentation de toutes les coupes intermédiaires. Deux méthodes d’interpolation et de propagation ont été utilisées dans le but d'interpoler sur toutes les coupes du volume d'intérêt ces segmentations manuelles 2D. Pour l'approche d'interpolation dite «Lagrangienne », le recalage entre les segmentations manuelles inférieures et supérieures du volume d'intérêt a été estimé et une interpolation linéaire a été appliquée entre la transformation résultante et l'identité afin d’obtenir le masque des n coupes intermédiaires manquantes. L'approche de propagation, dite « Eulérienne», était itérative et consistait en des recalages successifs de chaque coupe IRM (image en niveau de gris) avec la coupe suivante. Les masques propagés Mi ont ensuite été générés par l’application de la combinaison des champs successifs aux masques manuels. In fine, une fusion de ces deux approches a été utilisée afin de n’en conserver que les avantages - i.e. le suivi des déformations anatomiques locales (approche Eulérienne) et la convergence des Mi vers la coupe cible Mn (approche Lagrangienne). Notre approche a été évaluée sur une base de données composée de 25 séries d’images IRM de cuisse de volontaires sains. Unindice de similarité DICE (DSI) a été utilisé pour estimer la performance de notre méthode au regard d’une segmentation manuelle des 4 muscles individuels du quadriceps femoris (QF).
Fichier non déposé

Dates et versions

hal-01560300 , version 1 (11-07-2017)

Identifiants

  • HAL Id : hal-01560300 , version 1

Citer

Augustin C. Ogier, Michaël Sdika, Alexandre Fouré, Arnaud Le Troter, David Bendahan. Segmentation des muscles individuels en IRM basée sur des approches de recalage non-linéaire. 3ème Congrès de la Société Française de Résonance Magnétique en Biologie et Médecine (SFRMBM), Mar 2017, Bordeaux, France. 2017. ⟨hal-01560300⟩
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